病院に入院しているときも介護保険の申請を出すことはできますが、入院しているということは、何らかの医療行為の必要が生じていると思われます。本来、介護保険のサービスは、治療して病気は治ったものの介護の必要な人が対象となるものです。
普通、入院していれば身の回りのことも医療行為の一部として看護士など病院の職員が行ってくれますので、入院患者は介護保険からのサービスを受けることはできません。